火山图怎么看

火山图(Volcano plot)是一种用于展示基因组拷贝数变异(CNV)的图形表示方法，要正确阅读火山图，需要关注以下几个关键点：

1、基线：火山图中的水平线称为基线，表示每个基因座的平均拷贝数，正常组织与异常组织之间的差异可以通过基线值来衡量，较低的基线值表示CNV更为明显。

2、山峰：火山图中的垂直线称为山峰，表示基因座中CNV的具体数值，山峰的高度表示CNV的大小，山峰越高、越陡峭，表示CNV越显著。

3、分布：观察火山图时，需要注意各个基因座的CNV分布情况，如果大部分基因座都存在较高的CNV,说明可能存在某种疾病或异常情况，还需要关注CNV的分布是否均匀，以排除某些基因座受到特殊处理的可能性。

4、统计分析：火山图下方通常会提供一些统计信息，如平均值、标准差、百分位数等，这些统计数据有助于了解CNV的整体水平和分布特征。

5、相关性分析：部分火山图还会提供基因集富集分析(GSEA)或模块度分析(Modularity)等相关结果，这些结果可以帮助我们进一步了解CNV与特定生物过程或疾病之间的关系。

阅读火山图时需要注意基线、山峰、分布、统计分析以及相关性分析等多个方面，通过综合分析这些信息，我们可以更好地理解基因组拷贝数变异的特征和意义。